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呼吸内科为我院建院以来最早独立的科室之一，由我省著名老一辈呼吸病学专家赵博斯、叶孔鑫组建及栽培，现有病床50张（其中单间病床13张，重症监护病床6张），变态反应室1间，肺功能室1间，气管镜室及准备室各1间。科室梯队建设完善，医疗设备先进，在省内具有较高的学术地位和影响力，特别是肺部感染性疾病、支气管哮喘、慢性阻塞性肺病、脱敏治疗、气管镜检查及呼吸系统疑难病的诊治等方面居省内领先地位，近年来多次获得省卫生厅科技进步奖及新技术奖励。在教学方面承担哈尔滨医科大学、佳木斯大学及牡丹江医学院等医学院校五年制医学本科教学，此外还承担进修医师的教学工作。

呼吸科年门诊量在1万5千人次左右，年住院患者约2000人次左右，住院患者疾病涵盖呼吸系统常见、疑难以及危重疾患。为保证门诊质量，每周一、二、三、五，六专家门诊均由本科正、副高职医师出诊，普通门诊均有主治医师及以上职称医师出诊。现开展支气管哮喘及变态反应规范化脱敏治疗。